遺伝情報解析室
遺伝情報解析室ではキャピラリー型DNAシークエンサーを用いたDNAシークエンス解析を受託しています。また2021年度より関連するセミナーも開催しています。
連絡先
電話番号：075-753-4418 （内線 16-4418）
E-mail：infoseq[＠]support-center.med.kyoto-u.ac.jp
※アットマークのカッコを外し、半角英数に直してご使用下さい。
DNAシークエンス受託解析
利用方法
利用される方は、予めKUMaCoのページからiSAL利用登録を行ってください。登録は毎年度必要です。
利用登録がお済みの方は、KUMaCoマイポータルから依頼してください。依頼書を印刷し、調製したサンプルとともに下記までお持ちください。
解析後のデータは利用登録したメールに送付いたします。
（2022年6月9日より受付場所・受付時間を変更しました。）
- サンプル提出場所：医学部構内 総合解剖センター棟東館4階401a
- 受付時間：平日 8:00～20:00
（ただし8:00-9:30、17:00-20:00に提出する場合は認証ICカードで開錠が必要です。詳細は「受付時間の拡大について（PDF）」をご確認ください。
ダウンロード
- 内規・利用負担金価格（価格は受託解析内規別表をご覧ください）
- 依頼方法（KUMaCoマニュアル「6.DNAシークエンス受託解析」）
（iSAL HPに掲載しているものと同じものです） - DNAシークエンス受託解析利用の手引き(2023年6月版、PDF)
- KUMaCo依頼用サンプルネームシート（1~48サンプル用、EXCEL)
- KUMaCo依頼用サンプルネームシート（49~96サンプル用、EXCEL)
- DNAシークエンス受託解析を効率よく利用して頂くために(2019年4月版、PDF)
使用機種
Applied Biosystems® 3500xl Genetic Analyzer
（ThermoFisherScientific社)
フラグメント解析
2024年度よりフラグメント解析用サンプルの泳動を受け付けています。
3500xl Genetic Analyzerを用いて泳動し、結果を返却いたします。
使用可能な蛍光色素は6-FAM,VIC,NED,PET,LIZ(Dye Set G5)です。
納期はサンプル数や3500xl Genetic Analyzerの稼働状況等で変動いたします。
詳細はメールにてお問い合わせください。
遺伝情報解析室セミナー
説明会開催情報はトップページのNEWSもご覧ください。
- (第16回)*募集中
「RNA-seq解析実践編 ～ 公開データを用いた解析をステップ毎に解説～」
日時 ： 2024年12月05日(木) 16:00-17:00
開催形態： オンライン（Zoom）
講師： アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄様
言語：日本語
対象者：学内者はどなたでも可、学外者は2024年度iSAL利用登録者のみ
申込方法 ：以下のURLからお申込みください。
https://amelieff.jp/241205_kyoto/
締切 ： 2024年12月04日(水） 13:00
＊締め切り後、申込者全員にZoom接続情報等をメールでお知らせします。
＊本セミナーはアメリエフ社様のご厚意により、セミナー終了後1カ月間、申込者限定でアーカイブ配信されます。上記日時に参加できない方もお申込みいただければ後日視聴可能です。 - (第15回)
「【最先端機器紹介】 次世代プロテインシークエンシングプラットフォーム Platinum®」
日時：2024年9月18日（水）16:00-16:45
開催形態：オンライン（zoom）
講師：富永みずき様（トミーデジタルバイオロジー株式会社）
言語：日本語 - (第14回)
「SALSA MLPA® kit 紹介セミナー」
日時：2024年7月25日（木）16:00-17:00
開催形態：オンライン（zoom）
講師：小林 丈二様 （株式会社ファルコバイオシステムズ） - (第13回)
「バイオインフォマティクスを活用したRNA-seq/シングルセルRNA-seq解析入門」
日時：2024年6月12日（水）16:00-17:00
開催形態：オンライン（zoom）
講師：アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄様 - (第12回)
「フラグメント解析セミナー」
日時：2024年5月28日（火）15:30-16:45
開催形態：オンライン（zoom）
講師：草野 順子様 （サーモフィッシャーサイエンティフィック） - (第11回)
「キャピラリーシーケンサセミナー (DNAシークエンス解析の基礎)」
日時：2024年5月27日（月）15:30-17:00
開催形態：オンライン（zoom）
講師：草野 順子様 （サーモフィッシャーサイエンティフィック） - (第10回)
「NextSeq 1000/2000とMiSeqの紹介と 実施可能なアプリケーションの紹介」
日時：2024年2月21日(水) 16:00-18:00
開催形態：オンライン（Zoom） - (第9回)
「NGS初心者向け：イルミナシークエンスとは」
日時：2024年2月20日(火) 16:00-18:00
開催形態：オンライン（Zoom） - (第8回)
「【最先端機器紹介】 空間発現解析プラットフォームVisium CytoAssistと
ハイプレックスin situプラットフォームXenium Analyzer」
日時：2024年1月11日(木) 17:00-18:00
開催形態：オンライン（Zoom） - (第7回)
「フラグメント解析」
日時：2023年8月1日(火) 15:30-16:45
開催形態：オンライン（Zoom） - (第6回)
「DNAシークエンス解析の基礎」
日時：2023年7月27日(木) 15:30-17:00
開催形態：オンライン（Zoom） - (第5回)
「フラグメント解析」
日時：2022年11月16日(水) 15:00-16:15
開催形態：オンライン(zoom) - (第4回)
「MiSeqとNextSeq2000の紹介」
日時：2022年11月4日(金) 16:00-17:30
開催形態：オンライン(zoom) - (第3回)
「次世代シーケンサーとは？」
日時：2022年11月2日(水) 16:00-17:30
開催形態：オンライン(zoom) - （第2回）
「DNAシークエンス解析の基礎」
日時：2022年6月1日 (水) 15:00-16:30
開催形態：オンライン（Zoom) - （第1回）
「DNAシークエンス解析の基礎」
日時：2021年6月3日（木）14:00-16:15
開催形態：オンライン（zoom）
休止・終了したサービス
バイオインフォマティクス解析（2022年4月以降休止）
担当者の異動に伴いサービスを無期限休止いたしました。
参考）前任者・飯田元特定助教（現・近畿大学講師）のホームページはこちら
高速シークエンサー受託解析（2022年3月末終了）
使用機種
Life Technologies（Ion Torrent）社製
Ion Protonシステム