遺伝情報解析室
遺伝情報解析室ではキャピラリー型DNAシークエンサーを用いたDNAシークエンス解析を受託しています。また2021年度より関連するセミナーも開催しています。
連絡先
電話番号：075-753-4418 （内線 16-4418）
E-mail：infoseq[＠]support-center.med.kyoto-u.ac.jp
※アットマークのカッコを外し、半角英数に直してご使用下さい。
DNAシークエンス受託解析
利用方法
利用される方は、予めKUMaCoのページからiSAL利用登録を行ってください。登録は毎年度必要です。
利用登録がお済みの方は、KUMaCoマイポータルから依頼してください。依頼書を印刷し、調製したサンプルとともに下記までお持ちください。
解析後のデータは利用登録したメールに送付いたします。
（2022年6月9日より受付場所・受付時間を変更しました。）
- サンプル提出場所：医学部構内 総合解剖センター棟東館4階401a
- 受付時間：平日 8:00～20:00
（ただし8:00-9:30、17:00-20:00に提出する場合は認証ICカードで開錠が必要です。詳細は「受付時間の拡大について（PDF）」をご確認ください。
ダウンロード
- 内規・利用負担金価格（価格は受託解析内規別表をご覧ください）
- 依頼方法（KUMaCoマニュアル「6.DNAシークエンス受託解析」）
（iSAL HPに掲載しているものと同じものです） - DNAシークエンス受託解析利用の手引き(2023年6月版、PDF)
- KUMaCo依頼用サンプルネームシート（1~48サンプル用、EXCEL)
- KUMaCo依頼用サンプルネームシート（49~96サンプル用、EXCEL)
- DNAシークエンス受託解析を効率よく利用して頂くために(2019年4月版、PDF)
使用機種
Applied Biosystems® 3500xl Genetic Analyzer
（ThermoFisherScientific社)
フラグメント解析
2024年度よりフラグメント解析用サンプルの泳動を受け付けています。
3500xl Genetic Analyzerを用いて泳動し、結果を返却いたします。
使用可能な蛍光色素は6-FAM,VIC,NED,PET,LIZ(Dye Set G5)です。
納期はサンプル数や3500xl Genetic Analyzerの稼働状況等で変動いたします。
詳細はメールにてお問い合わせください。
遺伝情報解析室セミナー
説明会開催情報はトップページのNEWSもご覧ください。
- (第19回)*募集中
「【技術紹介】 InTraSeq™シングルセル解析が可能にする シグナルパスウェイ解析」
日時 ： 2025年6月3日(火) 16:00-16:45
開催形態： オンライン（Zoom）
講師： 阿部 晋也様（セルシグナリングテクノロジージャパン株式会社）
言語： 日本語
申込方法 ：以下のURLからお申込みください。
https://forms.gle/Tc8bFy9zwUuRFb8aA
締切 ： 2025年6月2日(月） 13:00
＊締め切り後、申込者全員にZoom接続情報等をメールでお知らせします。 - (第18回)
「【最先端機器紹介】 VIA Extractor™ 組織分散装置」
日時 ： 2025年3月12日(水) 16:00-17:00
開催形態： オンライン（Zoom）
講師： 齋藤 孝輔様（Cytiva）
言語： 日本語 - (第17回)
「【技術紹介】
超高感度 RNA in situ hybridization RNAscope™/BaseScope™」
日時 ： 2025年1月16日(木) 16:00-16:45
開催形態： オンライン（Zoom）
講師： 平林 京様 （プロテインシンプルジャパン株式会社）
言語： 日本語 - (第16回)
「RNA-seq解析実践編 ～ 公開データを用いた解析をステップ毎に解説～」
日時 ： 2024年12月05日(木) 16:00-17:00
開催形態： オンライン（Zoom）
講師： アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄様
言語：日本語
対象者：学内者はどなたでも可、学外者は2024年度iSAL利用登録者のみ - (第15回)
「【最先端機器紹介】 次世代プロテインシークエンシングプラットフォーム Platinum®」
日時：2024年9月18日（水）16:00-16:45
開催形態：オンライン（zoom）
講師：富永みずき様（トミーデジタルバイオロジー株式会社）
言語：日本語 - (第14回)
「SALSA MLPA® kit 紹介セミナー」
日時：2024年7月25日（木）16:00-17:00
開催形態：オンライン（zoom）
講師：小林 丈二様 （株式会社ファルコバイオシステムズ） - (第13回)
「バイオインフォマティクスを活用したRNA-seq/シングルセルRNA-seq解析入門」
日時：2024年6月12日（水）16:00-17:00
開催形態：オンライン（zoom）
講師：アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄様 - (第12回)
「フラグメント解析セミナー」
日時：2024年5月28日（火）15:30-16:45
開催形態：オンライン（zoom）
講師：草野 順子様 （サーモフィッシャーサイエンティフィック） - (第11回)
「キャピラリーシーケンサセミナー (DNAシークエンス解析の基礎)」
日時：2024年5月27日（月）15:30-17:00
開催形態：オンライン（zoom）
講師：草野 順子様 （サーモフィッシャーサイエンティフィック） - (第10回)
「NextSeq 1000/2000とMiSeqの紹介と 実施可能なアプリケーションの紹介」
日時：2024年2月21日(水) 16:00-18:00
開催形態：オンライン（Zoom） - (第9回)
「NGS初心者向け：イルミナシークエンスとは」
日時：2024年2月20日(火) 16:00-18:00
開催形態：オンライン（Zoom） - (第8回)
「【最先端機器紹介】 空間発現解析プラットフォームVisium CytoAssistと
ハイプレックスin situプラットフォームXenium Analyzer」
日時：2024年1月11日(木) 17:00-18:00
開催形態：オンライン（Zoom） - (第7回)
「フラグメント解析」
日時：2023年8月1日(火) 15:30-16:45
開催形態：オンライン（Zoom） - (第6回)
「DNAシークエンス解析の基礎」
日時：2023年7月27日(木) 15:30-17:00
開催形態：オンライン（Zoom） - (第5回)
「フラグメント解析」
日時：2022年11月16日(水) 15:00-16:15
開催形態：オンライン(zoom) - (第4回)
「MiSeqとNextSeq2000の紹介」
日時：2022年11月4日(金) 16:00-17:30
開催形態：オンライン(zoom) - (第3回)
「次世代シーケンサーとは？」
日時：2022年11月2日(水) 16:00-17:30
開催形態：オンライン(zoom) - （第2回）
「DNAシークエンス解析の基礎」
日時：2022年6月1日 (水) 15:00-16:30
開催形態：オンライン（Zoom) - （第1回）
「DNAシークエンス解析の基礎」
日時：2021年6月3日（木）14:00-16:15
開催形態：オンライン（zoom）
休止・終了したサービス
バイオインフォマティクス解析（2022年4月以降休止）
担当者の異動に伴いサービスを無期限休止いたしました。
参考）前任者・飯田元特定助教（現・近畿大学講師）のホームページはこちら
高速シークエンサー受託解析（2022年3月末終了）
使用機種
Life Technologies（Ion Torrent）社製
Ion Protonシステム